A preocupação da BCQ com a qualidade inclui o acompanhamento das matérias primas, ou seja os meios de cultura em todas as etapas das análises.
Base de toda a pesquisa microbiológica, os meios necessitam de controles especiais: esterilidade e capacidade de promover o crescimento dos microrganismos, em alguns casos selecionando quais microrganismos se desejam que cresçam.
Por isso, toda carga de meios de cultura para esterilização, é acompanhada de indicadores biológicos, aferindo a eficácia da mesma.
 
     
   
 
É fundamental que o meio de cultura, promova o crescimento do microrganismo pesquisado, assegurando todas as características necessárias ao seu desenvolvimento, tais como nutrientes, pH etc. Da mesma forma, outros microrganismos presentes na amostra, mas indesejáveis à pesquisa, sejam inibidos.
Visando este equilíbrio, a cada lote, são realizadas inoculações de espécies e observados os resultados quanto à inibição e desenvolvimento do crescimento.
 
     
   
 
As metodologias para as pesquisas microbiológicas encontram-se nas várias referências bibliográficas aceitas internacionalmente e utilizadas nas portarias e resoluções governamentais que regem as pesquisas para os mais diferentes produtos e matérias primas.
Assim, a BCQ utiliza-se da United States Pharmacopea, USP, diretriz para as pesquisas microbiológicas em fármacos, cosméticos, matérias-primas químicas etc. Standart Method's, referência internacional para análise da água, além de seguir portarias ministeriais que normatizam as pesquisas microbiológicas, p. ex.: Resolução RDC 154 para unidades de hemodiálise, MS 1480 para produtos higiênicos descartáveis, entre outras.
 
     
   
 
Com o advento dos conceitos de Qualidade Total e Normatização Internacionais, iniciou-se extensa documentação de técnicas e procedimentos. Este objetivo atende a duas necessidades: apresentação a clientes e auditores interessados e informação aos profissionais que diariamente utilizam-se destas técnicas.
Assim, a BCQ documenta todos os seus procedimentos, de acordo com diretrizes atuais.
 
     
   
 
Visando sua adequação como laboratório terceirizado de Controle de Qualidade microbiológico, a BCQ possui documento de Responsabilidade Técnica, do Conselho Regional de Farmácia.
 
     
   
     
  Atualmente a BCQ possui:
 
     
   Habilitação na REBLAS.  
 
 Licença de Funcionamento do Ministério da Agricultura e Agropecuária para análises microbiológicas.
 
 
 Cadastro de funcionamento junto ao Centro de Vigilância Sanitária - CVS.
 
   Alvará de funcionamento da Prefeitura do Município.  
 
 Certificado de Responsabilidade Técnica do Conselho Regional de Farmácia.
 
 
 Documentos de validações de equipamentos (estufas, autoclaves, fluxos laminares, balanças etc.) e área limpa, além da documentação de procedimentos descrita acima.